

構(gòu)建有潛在高親和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-變形桿菌(USCα)的基因
文章來源:撰稿/供圖:王越 | 發(fā)布時(shí)間:2020-01-16 | 【打印】 【關(guān)閉】
近日,地外海洋系統(tǒng)研究室與普林斯頓大學(xué)地球科學(xué)系Tullis C. Onstott教授研究團(tuán)隊(duì)合作在國際期刊《Microbiology Resource Announcements》上發(fā)表了題為“Metagenome-Assembled Genome of USCα AHI, a Potential High-Affinity Methanotroph from Axel Heiberg Island, Canadian High Arctic”的論文。深海所劉翠艷研究員為通訊作者。
該研究團(tuán)隊(duì)在2011-2013年期間在加拿大北極高地海伯格島(Axel Heiberg Island;AHI)檢測到含低碳的凍土夏季時(shí)分是甲烷匯,并在2015-2016年報(bào)道了AHI融凍層含活躍的微生物,負(fù)責(zé)氧化空氣中低甲烷濃度的微生物豐度非常低(~1%)。不過,這些高親和力的甲烷氧化菌未被培養(yǎng)和分離。
本研究從21個融凍層的實(shí)驗(yàn)樣品提取的宏基因組數(shù)據(jù),通過拼接手法,構(gòu)建了有潛在高親和力的甲烷氧化菌Upland Soil Cluster α-變形桿菌(USCα)的基因組,從而揭示其生理和生長需要。

拜葉林克氏菌科甲烷氧化菌與USCα AHI的基因組比較(Rusley et al.,2019)

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