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　　近日，地外海洋系統(tǒng)研究室劉翠艷研究員作為共同作者在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《Environmental Microbiome》發(fā)表了題為“Genome-centric resolution of novel microbial lineages in an excavated Centrosaurus dinosaur fossil bone from the Late Cretaceous of North America”的學(xué)術(shù)論文。 

　　古生物學(xué)研究曾頻繁報(bào)道：中生代恐龍化石經(jīng)過(guò)約2.5億年~6500萬(wàn)年仍然出乎意料地保存著內(nèi)源性有機(jī)物（如膠原蛋白和血管）。但考慮到蛋白質(zhì)易于降解，并且在逾百萬(wàn)年的時(shí)光里微生物很多已聚居于骨骼中的孔隙內(nèi)，這些內(nèi)源性的軟組織是否可以殘存在中生代化石骨骼中是一直備受爭(zhēng)議的。盡管研究人員對(duì)蛋白質(zhì)的不穩(wěn)定性進(jìn)行了廣泛研究，恐龍化石骨骼中微生物群的基因組多樣性及其在化石形成學(xué)（又稱埋藏學(xué)）中的潛在作用仍不明晰。因此，研究人員對(duì)從白堊紀(jì)晚期尖角龍骨骼及其表面的泥巖中發(fā)現(xiàn)的微生物進(jìn)行了基因組分析，從而深入了解微生物改造骨骼化石的潛力。 

　　本研究從宏基因數(shù)據(jù)組裝出46個(gè)高質(zhì)量的基因組，分別代表6個(gè)細(xì)菌門及1個(gè)古菌門。基因組的分析和比較結(jié)果指出這些基因組大部分都顯示是新的綱、目、科、屬或種且未曾成功被分離為純培養(yǎng)。相比包裹骨骼的泥巖樣品，骨骼富集了Nitriliruptoria, Deltaproteobacteria and Betaproteobacteria幾個(gè)綱里的基因組。對(duì)基因組功能基因的詮釋，揭示了多個(gè)物種可能參與碳、氮、硫和鐵的代謝。蛋白組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)很多微生物基因已表達(dá)，相反，沒(méi)有發(fā)現(xiàn)內(nèi)源性恐龍膠原蛋白肽。研究表明：出土的恐龍骨骼是微生物（包括新譜系）的棲息地；與外部沉積物相比，骨骼化石內(nèi)部獨(dú)特的微生境和地球化學(xué)組分支持了較高的微生物生物量，也包含多組基因相互聯(lián)系的生物地球化學(xué)過(guò)程；這些微生物群落在中生代恐龍化石中的存在敦促科學(xué)家們?cè)趯ふ覛埓娴膬?nèi)源性生物分子時(shí)，必須格外審慎。

北美白堊紀(jì)晚期出土的尖角龍骨骼化石中由微生物介導(dǎo)的潛在生物地球化學(xué)途徑的示意圖